世纪之花与猪鲨公爵的强弱并非简单的数值对比，而是体现在战斗机制、难度侧重点以及对玩家准备工作的要求上。从游戏进程来看，世纪之花是推进主线必须击败的BOSS，击败全部三个机械Boss后，其花苞会在地下丛林随机生成，破坏即可召唤。而猪鲨公爵属于可选挑战的BOSS，需要在困难模式下于夜光蘑菇地捕捉松露虫，再前往世界两端的海洋区域将其作为鱼饵钓鱼才能召唤。两者召唤方式的差异，决定了它们与游戏主线剧情的绑定程度不同。
战斗机制与难度方面，两者呈现出截然不同的风格。世纪之花的战斗分为两个阶段，第一阶段会发射粉色尖刺和弹跳的刺球，当生命值降低后进入第二阶段，移动速度大幅提升，并会伸出多根触手进行近战攻击，同时释放可以被打掉的漂浮孢子。其难点主要在于丛林地下场地的限制，需要玩家提前挖掘开阔空间以便走位。猪鲨公爵则分为三个阶段，拥有高速冲刺、释放追踪泡泡和召唤鲨鱼龙卷风等多种攻击方式，进入第二阶段后攻击频率和范围会提升，第三阶段甚至会隐身并发动快速连续的冲刺。猪鲨离开海洋环境会进入狂暴状态，攻击力和防御力翻倍，因此对玩家的即时反应和持续机动能力要求极高。普遍认为，猪鲨的战斗节奏更快，容错率相对更低。
挑战世纪之花时，推荐提前在丛林地下建造一个宽阔的多层平台战斗场地，以方便躲避其攻击。武器选择上，巨兽鲨机枪配合魔晶弹或脓血弹等能降低敌人防御的弹药效果显著，叶绿连弩配合圣箭也是高效选择。防御方面，神圣套或叶绿套能提供不错的生存能力。应对猪鲨公爵，场地通常选择在海洋环境，建造长平台或菱形轨道以保持机动性至关重要。装备需侧重高机动性，翅膀、闪电靴等饰品不可或缺，武器推荐使用具有穿透或追踪能力的远程武器，如战术散弹枪搭配叶绿弹。无论挑战哪个BOSS，铁皮药剂、再生药剂等增益药水都是重要保障。
两者各有侧重。世纪之花是解锁丛林神庙的必要条件，击败后必掉神庙钥匙，并能首次掉落榴弹发射器等武器，对推进游戏进程有决定性作用。猪鲨公爵作为可选BOSS，击败后会掉落猪鲨链球、海啸弓、猪鲨之翼或虾松露坐骑等一系列强力装备和实用道具，能显著提升玩家在后续挑战中的战斗力。世纪之花的奖励关乎游戏进程解锁，而猪鲨的奖励更侧重于直接的战力提升。
关于挑战顺序的选择，需要综合玩家自身的装备水平与操作习惯。从游戏流程的顺畅度考虑，常规建议是在击败机械三王并准备好神圣或叶绿级别装备后，优先挑战世纪之花，以解锁神庙获取更高级的装备，之后再带着这些装备去挑战猪鲨公爵，这样整体难度曲线更为平滑。如果玩家操作熟练、对猪鲨的攻击模式有充分了解，也可以尝试提前挑战猪鲨以获取其强力奖励，但这通常意味着需要面对更高的战斗风险。两者的强弱感知很大程度上取决于玩家的准备程度和个人技术。
